코난 일행은 캠핑을 가는 길에 서도모 시내에서 가까운 시일 내에 완성될 일본 최고 쌍탑 마천루를 참관했다. 이 마천루 소유자도 오랑과 샤오란을 초청해 개막식에 참석해 코난 일행과 우연히 만났다. 일행은 비서의 지도하에 똑같이 생긴 두 개의 첨단 하이테크 쌍탑 마천루를 참관했다. 하지만 이 마천루에는 이 건물과 다른 관계를 가진 사람들이 많이 나타났고, 얼마 지나지 않아 첫 살인 사건이 발생했다. 그리고' 암흑조직' 멤버들이 건물 근처에 동시에 나타난다는 게 믿기지 않아, 그 시절 이후 밤늦게 누구와 연락하고 있었는지를 연상케 한다. (데이비드 아셀, Northern Exposure (미국 TV 드라마), 어둠명언) 코난의 진정한 신분은 그 녀석들에게 들킬까, 그리고 회원애의 진정한 신분은 또? 황혼 경찰관 등 어떤 설득에도 불구하고 쌍탑 마천루의 개막식은 예정대로 진행됐다. 코난은 전체 층 높이 300 미터 높이의 하이테크 마천루에서 발생한 이 살인 사건의 진상을 규명하기 위해 숙적, 즉 당초 코토 신에게 독약을 마시라고 강요한 범인, 검은 조직이 역사상 가장 무서운 공방전을 펼칠 것이다.